In den meisten Fällen werden ANCA zunächst im Labor mit der Methode der Antikörper-Färbung (Immunfluoreszenz) nachgewiesen. Dabei wird das Blutserum (das, was vom Blut übrig bleibt, wenn man die Blutkörperchen entfernt) auf Testzellen gegeben und mit einem speziellen Farbstoff gefärbt. Sind im Blutserum des Patienten ANCAs vorhanden,
binden diese an die Testzellen. Im Fluoreszenzmikroskop leuchten dann diese angedockten Antikörper grün auf. Zur weiteren Bestimmung der ANCA wird Ihr Arzt dann meist noch einen sogenannten ELISA-Test (englisch „Enzyme-Linked Immunosorbent Assay“) durchführen, ein weiteres spezielles Verfahren, mit dem sich ANCA sehr gut nachweisen
lassen.